AZRA se trenutno sastoji od dva odjela:

1. Projektni odjel
2. Odjel za regionalni razvoj

Rad svakog od ovih odjela organiziran je tako da se njihove zadaće i aktivnosti međusobno nadopunjuju i ne isključuju. Time je osigurano učinkovito korištenje AZRA-inih resursa na svakodnevnoj bazi.

Projektni odjel

Aktivnosti Projektnog odjela AZRA-e organizirane su na taj način da poboljšaju socio-ekonomski razvoj Sjeverozapadne Hrvatske. Osnovna zadaća Projektnog odjela jest:

• Upravljanje projektnim ciklusom za projekte od regionalnog značaja kroz pripremu i implementaciju projekata
• Podizanje kapaciteta sudionika u razvoju za upravljanje projektnim ciklusom kroz edukacije i konzultantske usluge
• Informiranje i koordinacija sudionika u razvoju vezano uz projektni ciklus kroz konzultacije, promociju raspisanih natječaja i pružanja tehničke pomoći u bilo kojoj fazi projektnog ciklusa

Projektni ciklus slijedi tijek projekta od početne ideje sve do njezine provedbe. On daje okvir koji osigurava konzultacije sa svim dionicima te definira ključne odluke, zahtjeve za informacijama i odgovornosti u svakoj od faza, kako bi tijekom trajanja projekta bilo moguće donijeti  odgovarajuće odluke. Projektni ciklus se sastoji od šest faza: programiranje, identificiranje, formulacija, financiranje, provedba i evaluacija.

Odjel za regionalni razvoj

Odjel za regionalni razvoj podijeljen je u sljedeće pododjele:

• Kadrovski i računovodstveni odjel,
• Ured hrvatskih regija,
• Informatička podrška,
• Ured za energetsku učinkovitost te
• Regionalni razvoj.

 Aktivnosti Odjela za regionalni razvoj AZRA-e usmjerene su na učinkovitu koordinaciju i poticanje regionalnog razvoja a organizirane su na taj način da poboljšaju socio-ekonomski razvoj Sjeverozapadne Hrvatske. Osnovna zadaća Odjela za regionalni razvoj jest provođenje politike regionalnog razvoja kroz:

• Izradu strateških razvojnih strategija županije te strateških dokumenata za općine i gradove Varaždinske županije
• Sudjelovanje u radu partnerskih tijela za razvoj Varaždinske županije
• Praćenje socio-ekonomskog razvoja na lokalnoj, regionalnoj i nacionalnoj razini putem provedenih projekata
• Koordinaciju i partnerstvo s dionicima regionalnog razvoja, njihovo informiranje te pružanje stručne pomoći u strateškom planiranju, gospodarstvu, poljoprivredi, turizmu i učinkovitom gospodarenju energijom